Военные сталкеры — солдаты, прошедшие после опыта службы в Зоне специальную подготовку, или сталкеры, подписавшие контракт с армией. Снабжаются большим количеством вспомогательной аппаратуры, хорошо вооружены и экипированы. В основном используются для изучения причин и последствий катастрофы, а также занимаются картографированием Зоны. Могут ходить как поодиночке, так и группами до пяти человек. Обычных сталкеров к себе не подпускают - сразу же открывают огонь.

Экипировка и вооружение:
Одеты в надёжные армейские бронежилеты. Вооружены в основном отечественным оружием, которое поставляется в Зону.

Отношения между группировками:
К сталкерам, как правило, относятся агрессивно, так как все неофициальные лица в Зоне формально являются «местной фауной» и подлежат уничтожению. Правда, военные легко подкупаются. Имеют нормальные отношения с учёными и «Долгом», хотя с последними часто конфликтуют.