Глава 1
Сталкер(ГГ) с напарником находят странный артефакт на свалке. Напарник умирает в аномалии пытаясь достать этот артефакт. У нас есть выбор, попытаться достать артефакт или уйти. Если уходим - начинается фриплэй. Достаём артефакт и он начинает с нами взаимодействовать.
Артефакт зовёт на Агропром. Идем в комплекс, наблюдаем за сценой расстрела матёрых сталкеров. Нас замечают - убегаем на янтарь видим как военные зачищают янтарь от всего, что движется, артефакт сигнализирует о том, что надо бежать. Бежим в сторону дикой территории. Нас ловят.
Глава 2
Очухиваемся в бункере ученых, запертыми с умирающем сталкером. Он оказывается другом тех самых, кого расстреляли на агропроме, говорит, что происходит, что-то странное. Он умирает. Артефакт не дает нам умереть, ведет из бункера на ДТ.
убегаем, Янтарь пуст. Дикая территория тоже. Бежим в бар. Бар полупустой, сталкеров почти нет. Расспрашиваем бармена. Он говорит, что никто не может пробиться с южных территорий в бар. Просит разузнать, что происходит. Артефакт ведёт нас в Тёмную Долину. На Свалке приходит сообщение от Бармена, что на Агропром лучше не соваться.
В Тёмной долине никого. Артефакт ведёт в Х18. В лаборатории много полумертвых искалеченных сталкеров. на нижних уровнях находим сталкера, который говорит нам уходить. Находим документы, включается протокол защиты. Убегаем из Х18. В документах видим проект - "Тьма". Нас ловят на выходе и вырубают и запихивают обратно в лабораторию. Очухиваемся в окружении мертвых сталкеров.
Артефакт требует найти кого-то в лаборатории. Находим трупы учёных в которых идет речь про второй выход из лаборатории. Находим вторую дверь и выходим. Оказываемся в темной лощине в заброшенной лаборатории. Приходит карательный отряд военных, артефакт говорит - убегать. бежим со всех ног.
Глава 3
Оказываемся в в деревне, где находим отряд выживших сталкеров из лаборатории. Они просят обыскать деревню на предмет еды. Находим, что просят. Узнаем, что из зоны не выйти, и что военных стало слишком много и что военные что-то или кого-то ищут. Уходим на свалку. Артефакт просит найти девочку на севере зоны и ведет нас в Мертвый город. Идем в бар. Узнаем про переход в МГ из лаборатории Х16.
Идем в Х16. Лаборатория заполнена трупами сталкеров. На нас выходит призрак Призрака и рассказывает, что здесь произошло. Доводит нас до перехода, но рекомендует нам не соваться туда. Переходим, в городе появляется ощущение, что за нами следят, но каждый раз как мы засекаем сигнал пда девочки в домах, он пропадает.В конце-концов нас ловят.
Глава 4
Оказываемся за решеткой в здании совета. Артефакт говорит, что где-то спрятан ствол. Находим ствол и выбираемся по стелсу из заключения.Бежим по-дороге к переходу. Переход ведет нас на склады. На складах приходи на пустую базу военных. К нам выходит призрак Клыка и говорит, что мы должны найти выживших на радаре. Находим выживших у заброшенной лаборатории.
Говорят, что это не лаборатория, а часть путепровода на Припять. Переходим туда вместе с ними, доходим до припяти. В Припяти к нам выходит призрак Стрелка. Узнаем , что он один из хранителей зоны, и что нам надо найти девочку. Находим её в детсаду. Оказывается, что она голограмма, через которую с нами общается ученый. Надо найти ученого. Идем в лабораторию по-наводке ученого. Находим документы.
В документах узнаем, что военные действуют по-поручению одного из генералов, и что кто-то из сталкеров ему чем-то насолил. Пытаемся найти этого сталкера. Выходим из Припяти на юпитер. На заводе к нам снова приходит голограмма девочки. Ученый говорит, что этот сталкер украл у военных какие-то данные. В конце диалога на учёного (Девочку-голограмму) нападают. Мы видим как она(он) умирает. Мы уходим с Юпитера и вновь оказываемся в МГ.
Глава 5
Артефакт зовет нас найти лабораторию под городом. Лаборатория снова полна трупами, на этот раз военные и ученые. Находим ученого, который с нами общался. Находим у него документы и узнаем, что на них напал какой-то культ Тьмы. Слышим приближающиеся вертушки. Уходим.
Выходим в западной Припяти. Артефакт ведет нас в центр. Находим секретную лабораторию под Припятью. переходим туда. Нас встречают культисты. Они ведут нас к лидеру. Общаемся с лидером и узнаем, что тот сталкер давно мертв, что он украл у военных чудо-артефакт. И дает нам выбор.
Примкнуть к Культу, который ищет этот искусственно-созданный артефакт у военных. Либо нам придется пройти испытание, которое чревато смертью(Правильный выбор).
Выбираем испытание. Нас оставляют запертым на нижнем уровне лаборатории без оружия. Артефакт ведет нас через подземелье. Три раза мы на грани смерти, но к нам поочередно приходят призраки Призрака, Клыка и Стрелка, спасая нас. Проходим испытание. Нас телепортирует на кордон, прямо в кабинет местного офицера.
На допросе рассказываем ему всё про культистов. Военные заставляют нас штурмовать вместе с ними Лабораторию культистов. Выносим лабораторию, и в конце находим артефакт Тьма. офицер отбирает артефакт, вырубает нас и мы вновь оказываемся на нижнем уровне лаборатории в полусмерти наш артефакт выводит нас из лаборатории и мы оказываемся на Агропроме куда и привезли артефакт.
Глава 6
Крадем артефакт и бежим. Пока мы бежим в бар, к нам приходят угрозы от военных. Приносим артефакт бармену. Он рассказывает о свойствах артефакта Тьма, который при активации способен превратить всю планету в Зону. Наш артефакт-путеводитель предлагает нам прогуляться в Заброшенный лес. В лесу нас встречают призраки группы Стрелка и ведут нас на генераторы. Они говорят, что нам предстоит выбор.
На генераторах призраки ведут нас к пруду. У пруда к нам присоединяются призраки ученого(девочки) и лидера культистов. У культиста узнаем, что он и был тем самым сталкером, который выкрал Тьму у военных в первый раз. У ученого узнаем,что он и был тем ученым, что сделал создал этот артефакт, и что артефакт невозможно уничтожить и единственный вариант избавления от Тьмы это возвращение в прошлое ценой своей жизни.
Снова выбор. Вернуться в прошлое или оставить артефакт себе. В первом случае - уходим с артефактом в центр пруда. Нас переносит на катсцену в лабораторию, где призрак ГГ убивает ученого. ГГ переносится обратно в настоящее и становится призраком.
Во-втором случае выходим из генераторов. Наш артефакт-путеводитель исчезает, мы переходим из генераторов, и видим катсцену в которой нас ловит тот самый военный офицер, убивает ГГ и отбирает артефакт.

Наемник по кличке Хемуль решил пойти в З.О.Н.У. за артефактом "Черный Ангел" для его больной раком дочери. У него амнезия и он не помнит имени своей дочери и то, чем больна (если вообще больна), но уверен, что она болеет именно раком и ей нужен именно "Черный Ангел". ГГ появляется в Рыжем Лесу и говорит с главарем наемников Альфой для того, чтобы найти себе работу, попутно спрашивая про искомый артефакт. Глава говорит, что он не знает и направляет к Леснику (он сидит на прежнем месте). А что по поводу контракта - нужно убить сталкера по кличке Темный Странник, место положение которого неизвестно. Награда: 1000000000000 руб. Хемуль идет разговаривать с Лесником на тему контракта и своей личной задачи. Старик говорит, что не знает, где именно "Черный Ангел" находится, но дает наводку на Темного Странника, который недавно пошел в шахту у лагеря. ГГ идет в указанное место, все обыскивает и никого и ничего не находит, но Хемулю приходит СМС от некого сталкера Митяя, который прости помощи. Идем к нему, убиваем кровососов, разговариваем со сталкером. Спрашиваем про арт и искомого сталкера. Митяй говорит, что видел того самого Темного Странника и нужный нам арт, который он носил с собой. Но за информацию о месте, на которе выдвинулась цель, спасенный требует арт из аномалии Симбионт. Если отказаться, Митяй станет враждебный, при убийстве мы ничего не получим и сюжет станет непроходимым. Несем арт сталкеру и получаем инфу. Преследуемый говорил, что он пойдет на НИИ Агропром, а потом на Свалку. Хемуль идет на Агропром (если пойти на сразу на свалку, то сюжетные скрипты не сработают) на фабрику (в Рыжем лесу также есть переход и на свалку). Говорим со сталкерами, они говорят, что мы опоздали, но предлагаеют работу. Соглашаемся. Им нужно, чтобы Хемуль зачистил подземелье Агропрома. Пока мы спускаемся, начинается катсцена, где главарь сталкеров в рацию говорит что - то в духе: "Темный Странник, тебя хочет прикончить какой - то найм. Хорошо, что он не пошел сразу на свалку". Убиваем всех в катакомбах, получаем награду. Идем на свалку. Получаем СМС от Темного Странника, где говорится, что он ждет нас на барахолке. Подходим, спрашиваем про арт. Он говорит, что спрятал в Варлабе. Пароль от входа он спрятал в деревне на Генераторах. Далее у нас есть выбор: убить на месте или отпустить. Если выбираем первый вариант, то он телепортируется в неизвестное место и квест на его убийство проваливается. Второй вариант: Темный Странник просто стоит. Если его атаковать, то он никуда не улетит и его можно будет убить, после чего можно подойти к Альфе и получить награду (помимо денег, мы получим экспериментальный наноэкзоскелет). Далее нам необходимо найти переход на генераторы. Говорим с Гариком, тот может привести нас на необходимую локацию. За услугу требует сбегать на Болота и найти в пещере артефакт "Осколок Монолита". Приносим арт и переходим на Генераторы. Находим записку с паролем, переходим в Варлаб. Ближе к арту мы наткнемся на представителя О - Сознания, который предлагает вступить в данную организацию. Отказываемся и убиваем его. Берем Черный Ангел и выходим из лабы. Игра пройдена. В финальный титрах узнаем, что его дочь уже в Зоне и она не была больна раком. А дочери у Хемуля на самом деле не было. Титры разработчиков ЗП.